虽然次日再次聚兵拿下大宝寺，但得到喘息机会的明智光秀得以带领近万残兵逃窜到了龙胜寺。
等丰臣秀吉围困龙胜寺的时候——德川家康、柴田胜家这两大织田家的重要势力也都围了上来，原时空独占为信长公报仇大义的丰臣秀吉，此际在军事和政治上都遭受了重大挫折。
而策划这一切幕后黑手，终于得偿所愿，后织田信长时代经过他的拨弄，丰臣秀吉距离统一日本，一下子变得遥遥无期起来、
万历十年的中元节那天，记录织田信长死讯的情报传到了朱翊钧手中。朱翊钧看过情报节略上短短的一句“明智光秀谋反，织田信长死于本能寺。”之后，长出了一口气。
对于日本攻略，在第一征拿下缅甸之后，朱翊钧判断原时空的“猴子”未必会有那个胆子如期进攻朝鲜。蝴蝶翅膀已经煽动，他的目光自然也盯上了日本——在东西方贸易将中国变成“世界银窖”之前，日本的白银将是朱翊钧设立金融体系重要一环。
日本岛孤悬海外，现在内部如同养蛊一般，各方玩命厮杀。而织田信长在拿下武田氏之后，统一天下指日可待——朱翊钧绝对不能允许日本在自己攻略它之前，出现统一的政权。他给军情局的任务是：“只做情报收集，绝对不允许干涉任何一方的势力涨消。”生怕自己胡乱插手，导致“本能寺之变”不能如期发生。
因此，在得知翁大立和吴善言等辈向日本出口军械之后，朱翊钧的怒气难遏。日本的军械生意当然好做，但织田信长掌握着最大财力，向日本出口军械只会加速织田信长对全日本的统一——这与朱翊钧的日本攻略计划背道而驰。
此时接到情报，织田信长如期丧生在本能寺，朱翊钧放下心来。织田信长如期死亡后，才是大明插手的时候。于是，随着本能寺之变的信息传入，当日岐阜城就突燃大火，尚在襁褓中的织田信忠长子秀信和织田家的奉行前田玄以在混乱中被杀。
朱翊钧拿起朱笔签字前，看了看眼前在玩积木的洛郡王。幼名“三法师”的织田秀信比洛郡王还要小，却被远在中国京师的自己派人卑劣的暗杀——而接到这项任务的军情局探子，甚至不知道总部为什么要大费周章，使用贵重的火油来岐阜城放火。
本能寺之变后，最能获得织田部下拥戴的就是三法师。朱翊钧这一手，直接将丰臣秀吉手中最大的砝码打掉了。而狙击手对黑田孝高的刺杀，导致了丰臣秀吉在山崎合战中失去了应有的水准，与明智光秀打的难解难分不说，还被柴田胜家和德川家捡了现成。
织田信长死亡后，会带给日本什么样的展开？而丰臣秀吉名望上升最快的山崎之战，本时空终于被朱翊钧给破坏的面目全非。丰臣秀吉会带着池田恒兴等人拥戴谁呢？刚断奶的织田秀则？还是和柴田胜家一样，拥戴织田信孝？选择很多啊，猴子和乌龟先生们！
朱翊钧推演了一番，将手中卷宗喝上，笑着对庄静嘉道：“给放到东瀛的档案里面吧。”庄静嘉是做熟这项工作的，闻言将卷宗拿起，放在坤宁宫东暖阁的第一排书架上。
书架刷着黑色油漆，光可鉴人。每次庄静嘉走到书架边，看着上面挂着“西洋”、“南洋”、“欧罗巴”、“东瀛”等木牌，都要吐吐舌头，同时对皇帝更加心折。