也正是在妖皇妖帝统领妖庭后，人族与妖族之间的大战再次爆发。
妖皇妖帝联手下凡欲除玉帝，此前，他们三人的争斗大多是为了悟道，而这一次却是生死大战！
三人激战百年，玉帝身负重创，而伤势愈发严重的轩辕人皇也不得不拖着老迈衰弱的身躯出关，与妖皇妖帝血拼。
那一日，轩辕剑断，人皇老迈，终不敌年轻的妖皇妖帝，血洒沙场，独留玉帝手捧人皇残尸咆哮上苍。
轩辕人皇战死，玉帝身负重创，在葬下了人皇尸身后，玉帝便就此消失养伤，而妖皇和妖帝也有整整一万载的光阴不曾出现。
人皇虽老，纵一身伤病，但昔年压得整个妖庭都喘不过气的轩辕氏又岂会是那么好杀的？人皇临死之前，轩辕剑崩裂之前，轩辕氏便一剑砍中了妖帝的元神，妖皇的帝拳也被他用轩辕剑击破，人皇纵死，也为妖皇妖帝留下了一生也难于抹去的伤病。
大战过后的一万载，人族与妖族都没有发生大战，但双方一直都在厉兵秣马，共同等待妖皇妖帝与玉帝养好伤势出关之时。
又是一万年后，妖皇出关，恢复到了全盛时期，可妖帝却一直没有显化踪迹，玉帝更是早在五千年前就重现出现在了大地之上，且与妖皇又大战了数次，不分胜负。
世人猜测，定是轩辕人皇临死前重创了妖帝，不然妖帝也不会坐关这么多年，甚至于说妖帝已然化道也不一定。
可妖皇却曾明确说过，“东皇一直都在，他在往更高境界冲击。”
世人疑惑，妖帝已然为圣，如何再往更高境界冲击？所有人都不知妖皇此言是真是假。
而就在妖皇与玉帝争锋的这几万年间，妖庭曾出现过一桩奇闻，那就是在这期间曾有一位修为低下，资质不堪的妖军居然已最快的时间内冲到了半圣境界，惹得妖皇亲自接见，还将他封为了妖庭元帅，更让人奇怪的是，这位妖庭新晋强者，在成为妖帅的半年后便离奇身死。
惹得妖庭大乱。
没有人知道，那位妖帅当年曾在妖庭天宫中捡到了一件神物，也是靠着那神物他才能在最短的时间内突飞猛进，但凡事都需付出代价，那神物帮助他拥有了极高的修为，可最后却也吸干了那位妖帅的一身修为，助其苏醒。
几万年后，神物流落到了天庭，被一个叫李老四的老东西在天庭宝库的角落里发现，送给了他不久前看中的一个年轻人，那个年轻人叫——黄小伟。
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妖帝坐死关几万年都不曾出现，诺大的妖庭也只剩下了妖皇一位圣者，而人族也唯有玉帝达到了圣者境，再加之魔祖重临世间，妖族与人族竟再一次进入到了一段诡异的和平时期。
双方几万年都没有爆发过大战，就连玉帝与妖皇也不曾交手，因为他们都知道彼此奈何不了对方，何况相比于对方，魔才是这个世间最该铲除的存在。
不论是人族还是妖族，这么多年都在尽全力清剿魔物，而坐等妖皇与玉帝进行生死大战，可始终也不见二者交手的魔祖终于等不下去了。
魔祖深知妖皇与神女羲和间伉俪情深，魔祖也看出妖皇道心唯一的弱点便是羲和神女，于是，当年趁妖皇闭关悟道之机，魔祖突然杀向妖庭，斩杀两位护道妖王，重伤妖相白泽，即便妖皇及时苏醒出关，可魔祖却早在激战时便在羲和神女的身上种下了一记魔种。
当妖皇出关的那一刻，魔祖没有选择将羲和神女引入魔道，相反他直接引爆了羲和神女身上的魔种！当着妖皇的面，杀掉了他的妻子！
魔祖想以此让妖皇道心破损，借机种下魔种，已妖皇的绝巅修为，助自己百尺竿头再进一步！
可魔祖这一次却算错了。
眼见爱人死于自己面前，妖皇悲吼，他的道心非但没有任何破损，相反，无与伦比的愤怒充斥在了妖皇眼中。
妖皇动怒了，与魔祖展开生死大战，极端愤怒的妖皇竟是令魔祖连种下魔种的机会都没有，便被打的吐血逃窜，而之后，妖皇更是举全妖庭之力发兵清扫魔族！
妖魔之战正式拉开，这一战整整打了一万载，妖庭伤亡惨重，大妖陨落无数，魔族这些年积累的各方魔君更是被妖皇斩尽杀绝，就连魔祖本人也在和妖皇的五千年大战中彻底身死，被妖皇活活打成了飞灰。
这一战后，妖皇受创严重，索性斩去了那道身，重新修炼，而魔祖也不知是否有意，他和妖皇最后的决战地，就在当年伏羲氏已身化作先天八卦大阵之所在，他的飞灰正是葬在了这里。
直到万年后，伏羲氏的转世身西伯前来寻自己前世的道果，被他趁机击杀吞噬，魔祖就此苏醒归来。
妖魔大战期间，人族也在玉帝的率领下围剿魔族，在妖皇和玉帝的协力下，天下魔族几乎都被杀尽，此后三界在没有大魔，此一战，三界平定。
而在这一战后，妖庭也近乎打残，此时妖皇身死，妖帝消失不见，妖相白泽无力抵挡玉帝与百万人族战师，便就此率不周仙山归隐于三界之外，以待来日。
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