过不多日，阮元向嘉庆询问伦贵利处理事宜的上疏，与浙西赈灾的奏疏一道，被送到了嘉庆案头。嘉庆也召集了几位军机大臣，对两大要事集中商讨。
“这个阮元啊，都做了大半年巡抚了，为何行事还是如此谨慎呢？”虽然嘉庆话是这样说，可庆桂、董诰等人都能听出，嘉庆并无责怪阮元之意，果然嘉庆续道“这伦贵利，仗着自己有个什么安南进禄侯的名号，就敢要挟于朕，他哪里是什么侯爵，这天下官爵，不待朕颁旨册封，便是僭伪之名！他有何资格在我大清君臣面前，自称进禄侯？朕看这伦贵利本为大清子民，却投奔安南于先，挟安南之兵劫掠我浙江沿海在后，如此无父无君，残虐百姓，就已经够得上凌迟！什么阮光缵的敕命，也教他拿来做护身符，真是岂有此理！传旨，伦贵利无需押解入京，圣旨一到，便在杭州就地凌迟处死！还有，庆桂，以朕的名义，给阮光缵去一道旨意，问他伦贵利究竟是不是他私相封授？他带兵劫掠闽浙沿海府县，有无他阮光缵的授意？无论他情况如何，这道旨都要严厉申饬于他！他什么意思，朕还不清楚？前些年以为朝廷大军在川陕作战，无暇兼顾于他，便有了不臣之心，眼下川陕战场，连战连捷，剿灭贼寇，指日可待，他阮光缵要是识时务，就知道该怎么做！”
“皇上明鉴，臣这就下去拟旨，定要让那安南阮主，重新慑服于我大清声威！”庆桂对于嘉庆这次的处置，并没有其他意见。而嘉庆所言本身也是实情，在勒保、额勒登保与德楞泰三员大将的积极作战下，不过半年，已成强弩之末的白莲教反清部队屡战屡败，到了嘉庆五年入秋之时，川楚战场形势，已变得逐渐向清军有利起来，有识之士都清楚，只需假以时日，继续围剿，这场仗必然以清军获胜告终。
“还有这道奏疏，阮元上言，今年浙西遭遇飓风暴雨，十多个府县耕田，均已损失大半，灾民已有约三十万之数，要求朝廷调拨赈粮四十万石……董诰，你也是浙江人，这浙江灾情，可否属实？”嘉庆继续问道。
董诰也当即答道“回皇上，浙江灾情，确实如阮元所言。臣家在富阳，故而近日多有浙江会馆主事人员，前来告知臣浙江灾情，浙西金华、处州等地，受灾犹重。而且先前皇上交给臣等的浙江布政使刘烒、按察使秦瀛、学政刘镮之上奏，也都提及了浙西灾情，故而臣以为，下放赈粮，已是刻不容缓。至于具体灾情，臣看阮元奏疏，也已经一并附上，户部自会一同核查，依阮元上报人数，决定发放赈粮之数。”
“既然已经刻不容缓，那就速速去诏户部会同发放赈粮吧。朕平日观高宗皇帝实录，清楚灾民赈粮之数，阮元上报灾民，依四十万石放赈，合乎旧例。若是户部没有其他意见，便尽快给浙江下令，留下四十万石漕粮，以作放赈之用，如何？”嘉庆清楚自己亲政不过一年有余，赈灾之事，必须及时办理，才能重振人心。只是按照规矩，放赈需由户部一并商议，是以有此决议，希望户部尽快有所行动，避免拖沓行事。
对于嘉庆的这些决定，董诰和戴衢亨都没有异议，即便是素来对阮元常有偏见的庆桂，眼看赈灾事大，也没有其他反对之言。阮元的两封奏疏，很快就有了批复。
到了八月初，嘉庆的诏旨发回了杭州，阮元接旨之后，便即提了伦贵利，依旨在杭州将伦贵利处刑。伦贵利试图依靠阮光缵威胁嘉庆的救命之计，被嘉庆直接粉碎。
而伦贵利自然也不会知道，仅仅三个月后，阮光缵的上表也到了北京，表文内声称自己愚昧无知，不该得罪清朝。伦贵利虽为自己私自册封，但北上劫掠，纯属伦贵利个人行为，并非自己授意，也完全认可了嘉庆处死伦贵利的决定。
即便如此，阮光缵在安南也已经是穷途末路，阮福映的旧阮军继续北进，连战连捷，终于在嘉庆七年攻破河内，俘杀阮光缵，安南西山阮氏便也就此灭亡。阮福映统一安南之后，向嘉庆上疏请求册封，并希望以南越之名代替安南。但嘉庆考虑到南越本为西汉时广东赵佗所建之国名号，担心阮福映有不臣之心，便将南越二字颠倒，改成越南，册封阮福映为越南国王，越南之名，自此而始。
而随着安南海盗的逐渐溃败，浙江的海防重点，也渐渐转移到了闽浙海盗之上。
但对于这时的阮元而言，救灾才是第一要务，嘉庆下诏之后不久，嘉白帮也来告知阮元，已经会同其他漕帮，将浙西所需的四十万石粮食运送到了杭州。阮元便让李赓芸总领放赈事宜，依每县上报灾民人数，逐一进行分发，一切放赈事宜，尽数公之于众，府县官吏试图暗中克扣之人，便没有了作伪的余地。