经过会商，决定由吴大溦和续昌赴朝查办。
吴大溦和续昌抵达马山浦后，袁世凯即派人将叙述事变经过的书面报告呈上。后在汉城和二人相见后，又当面为自己辩解。
但他承认自己没经请示，也主动为自己擅自开衅请罪。吴大溦和续昌没因此而责备他，肯定了他的做法。但要求他即刻搬出皇宫，以免落人口实。
本来以为平定甲申政变自己是奇功一件，没想到虽然没给自己惹出祸端，而最后也不过是没什么过失而已。
但是，袁世凯不是那种不求有功但求无过的人，所以，特别地沮丧。
从皇宫搬出，也使袁世凯很没有面子。
人就是这样，被人查办，查没查出什么事也会搞得满城风雨。加之与吴兆有等人反目，袁世凯的处境越来越困难。
但他不从自己身上找原因，而是怨天尤人，整日大呼人心难测；并称自己是“官运恶极”。一直以来一帆风顺的袁世凯，经不起这一系列的挫折，心灰意冷到了极点。
恰在这时，袁世凯的嗣母牛氏，从他给家人的信中得知袁世凯的环境险恶，吓得旧疾复发。急函袁世凯回家。
袁世凯正巴不得有这样的机会，就和吴大溦请假回国。
一八八五年一月三十日，用袁世凯自己的话说，终于离开汉城这个事非之地。
他乘超勇舰先赶到旅顺，看望了在那里任职的堂叔袁保龄。
两天后，吴大溦和续昌也到了旅顺，袁世凯和他们一起乘船去秦皇岛。
驶出不久，遇到浮冰，船无法前行，他们改去山东烟台。到三月中旬，才辗转返回直隶总督所在地天津。
想不到袁世凯这一次又因祸得福。吴大溦见到李鸿章后，对袁世凯大加赞扬，称其为奇才，是人才难得。
李鸿章本来就对袁世凯印象不错，听吴大溦如此一说，更加令眼相看，从此也就真正成为袁世凯的靠山。
吴大溦向朝廷汇报时，又把袁世凯大大吹捧了一番，使袁世凯这个从来名不见经传的人，成了众人瞩目的人物。
袁世凯和李鸿章虽然多次通信，但在天津是他们第一次见面，无论是仪表堂堂还是谈吐干练，都给李鸿章留下了极佳的印象。
李鸿章的意思，袁世凯还是返回朝鲜，但袁世凯坚持回家探母，李鸿章也就准了他的假。这样，袁世凯在离家几年后，踏上了回故乡河南项城的路。
一路上，他不知道自己很快会时来运转，是很消沉的。
脑海里总是浮现着自己那位朝鲜好友，金允植为自己送行的那首《送慰廷归河南》诗：“名高人多嫉，功成众所忌，此事古今同，处事谅不易；最值危急日，人敢敛手避；黜者怀首鼠，懦夫常惴惴；事定反觅疵，利**渐渍；遂将功为过，摧折丈夫志；君今浩然归，俯仰无所谓；天日照孔昭，贤才岂中弃；相见如不远，努力勉王事。”
这个世上如果还有理解和赏识自己的人，也就只有这位朝鲜朋友了！袁世凯长叹了一口气。
一九八五年三月，日本伊藤博文一行来华，谈判解决中日军队在朝鲜的冲突和撤军问题。
清**派李鸿章为权大臣与之谈判。
四月，经反复协商，签订了《天津条约》。
规定两国同时从朝鲜撤军，两国均不派员教练朝鲜军队。今后如发生变故或重大事件，需要派兵去朝鲜要相互照会，事定即撤，不得留驻。
这个条约虽然解决了中日当时的军事冲突问题，却为日本出兵朝鲜留下了伏机。
在谈判中，日本方坚决要求严惩袁世凯，遭到了李鸿章的严词拒绝。