面对整个九州急转直下的不利局面，甲斐宗运不愿主动向上杉将军家一方降服的主要原因，还是因为毛利家、相良家等前车之鉴在。
因为毛利家、相良家等大名都与上杉将军家一方交锋过，在降服后无一例外的被削减了领地。其中，相良家更是被削减了三分之一以上的领地。
阿苏家本就不是致力于开疆拓土的大名，核心领地主要是阿苏大社。若是向上杉将军家降服的话，阿苏家不再担任阿苏大社大宫司一职，那他甲斐宗运岂不是成了阿苏家的罪人？
虽说与阿苏家交好的原大友家重臣入田亲实不断致信阿苏惟将、甲斐宗运二人，希望他们能尽快认清形势，不要继续站在大友家一方，更不要负隅顽抗。但阿苏惟将、甲斐宗运二人皆是留信不报，置之不理。
随着，入田亲实、柴田绍安、户次玄三、志贺道益等诸多大友家重臣先后倒向上杉将军家一方后，就使得阿苏家与大友家直接的联系被彻底切断。同时，也意味着阿苏家无法获得来自大友家的任何支援。
在这样的形势下，阿苏家上下可谓是人心惶惶不可终日。
也就在甲斐宗运准备不顾自己四个儿子的强烈反对下，意图支持相良赖贞之际，相良赖贞、东以伯等人败亡的消息就传入了阿苏领。
如此一来，阿苏家就失去了介入相良家家督相续的绝佳时机。
听闻相良信房在上杉将军家的支持下继承相良家家督之位，并入主人吉城后，黑仁田丰后守率先致信身在人吉城的相良信房、上杉景满二人，表示自己愿意充当上杉军进入阿苏领的先导役，还将阿苏家上下人心浮动的消息也一并告知相良信房、上杉景满二人。
可黑仁田丰后守的举动还是被甲斐宗运所发现，甲斐宗运为了尽快稳定阿苏家上下，以及震慑阿苏家中意图倒向上杉将军家一方之人，便火速发兵袭杀了正在玉冈城镇守的黑仁田丰后守。随后，甲斐宗运为了斩草除根，将黑仁田一族上下七十余人除了自己的正室以外全部诛杀。
也正是因为甲斐宗运如此专断以及滥杀无辜之举，导致甲斐亲英、甲斐亲正、甲斐宣成、甲斐直武四人的极度不满，尤其是甲斐宗运的长子甲斐亲英。
因为黑仁田丰后守不仅仅是甲斐亲英的舅舅，而且先前在响野原之战中，甲斐一族还获得了黑仁田一族的粮草辎重、弓失弹丸的支援。如今，因黑仁田丰后守一人暗通上杉将军家一方，就将整个黑仁田一族覆灭，实在是令甲斐亲英难以接受。
故而，为了甲斐家以及主家阿苏家的前途，甲斐亲英甚至还说服了甲斐宗运的女婿早川休云、尹豆野山城守二人一同参与对甲斐宗运的下克上。
在甲斐宗运屠尽了黑仁田一族返回御船城之际，甲斐亲英当即向其发难，将甲斐宗运幽闭在御船城本丸的一处长屋之中。而后，他就火速对外宣布其父甲斐宗运因身患重症无法理政，便继任甲斐家家督以及阿苏家笔头家老一职。