虽然因为地形的缘故，不能大打出手，但摆脱了郧阳这个包袱后的孙传庭并不甘心只是在归州以西堵住顺军出川之路，于是孙传庭便请旨西进，在得到朱由崧批准后，孙传庭便制定了一个三路合击的作战方案。
根据这个作战方案，孙传庭以主力15000人在夷陵水师黄蜚部14000人的配合下，溯江而上，进攻巴东、巫山；北路军5000人自陆路经由高岚-峡口-仓坪-白湾-沿渡河-楚阳-关坪-两坪一线逼近巫山县城；长江以南的南路军4000人（主力为湘西土兵）同样一路翻山越岭，自陆路西进，迫向巴东。
面对孙传庭的进攻，已经将所部兵力扩充为万人的袁宗第、辛思忠部利用地形进行了顽强抵抗，但由于兵力太少，因此在南北两路陆师包抄夹击下，不得不陆续放弃了巴东、巫山两县，把队伍撤到了奉节，并试图依托瞿塘关和夔州府城，对孙传庭部展开阻击。
由于在进攻巴东、巫山时消耗了大量的粮秣辎重，所以，夺取了巫山后，孙传庭部失去了继续向奉节一线进攻的动能，只能转而沿着大宁河北上，分别收复了大昌、大宁两县，然后再次转入防守状态；由此，明顺两军便在瞿塘峡形成了新一轮的对峙······
明弘光二年三月十七日，济州水师一部将打着【皇明登莱巡按铁】、【左军都督府同知、济州水师总兵官、平波将军宁】旗号的京营新设立的勇士营一部，计一团兵马送上了威海湾海滩，对之前投清的威海卫城造成了威胁。
虽然明军只有一个团1200余人，但由于威海卫守军大多对明朝怀有感情，因此威海卫指挥使李奕、张先臣，指挥使同知胡长春、叶翼德、丁褒忠，指挥使佥事贺勋臣，千户贾天扬、王阁臣、邓有年等在确认当面部队的确由新任登莱巡按铁存法统帅后，便杀死亲附清廷的掌卫官沙行武、驱逐了其他几名同意更看好清廷的威海卫高层，率部反正。
而在李奕等人的带领下，威海卫麾下的金山备御左千户所、百尺崖备御后千户所及成山卫名下的寻山备御后千户所，相继易帜，再次回归了大明的统治。
得到威海卫及周边千户所反正的消息，清宁海州知州及投降清廷的宁海卫高层望风而逃，宁海州就此不战而落入了明军之手。
在得到宁海州易手的消息后，成山卫卫城、靖海卫卫城、大嵩卫卫城及宁津守御千户所、海阳守御千户所等周边卫所及文登县、福山县等地也纷纷宣布反正，由此，整个胶东半岛就在短短的十天内，重新变成了大明的领地。
但实际负责此次攻势的宁虎却知道，这种现象不过是昙花一现，所以，他一面命令勇士营第十七战兵团团长于通对赶来共襄盛举（凑热闹及骗粮饷）的各部反清武装进行整编和强化训练，另一方面并未固守宁海州城，而是想办法调动本地人力，在威海卫建设棱堡化要塞，以应对清军可能的反扑。