另外，太平军中的男女问题、男男问题和女女问题，居然也成了困扰杨秀清的一大难题。由于太平军一直以来都是男女分营，哪怕是夫妻也不得相聚，所以正常的生理需求也不得满足。短时期实行也就算了，要长期如此就难免生出许多问题了。首先当然是偷食禁果，冒着生命危险搞男女问题，标准的死了都要爱。杨东王闻之大怒，一口气砍了十几对苦命鸳鸯，总算刹住了歪风邪气。
然而，压下了男女问题，这男男问题和女女问题又一个个冒出头来了。呃，在太平天国，搞异性恋是非法的，搞同性恋……好像是合法的！除了五个有一大堆王娘的王，其余太平军的男性高层几乎都养气了男宠，而太平军女营的女将们则玩起了百合。真是大开风气之先啊！
而这等事情，如果是你情我愿也就罢了。不许人家男女相爱还不许人家搞基了？这太平军的上帝管得也忒多了吧？可是本来挺好的“兄弟之爱”和“姐妹之情”，偏偏惹出许多争锋吃醋或是恃力用强的事体。不时还有太平军的将领为了争夺娈童大打出手，真让杨东王头疼不已。
最后，那个杨秀清琢磨出来的《天朝田亩制度》的实行，也成了绊住太平天国前进脚步的一个原因。这个《天朝田亩制度》在后世是鼎鼎大名，凡是对历史有所了解之人，都晓得太平天国有这么一个制度，也知道该制度的核心是平分土地，因而许多人都对其大加赞赏。
但是，恐怕没有多少人知道，《天朝田亩制度》中虽然有平分土地的内容，但是平分土地并不是《天朝田亩制度》的全部。这个制度除了规定按人口和年龄平分土地之外，还提出了一系列管理民众、分配产品和官员产生任命的办法。涉及到经济、政治、军事、文教和社会改革等多方面的政策和措施。
除了平分土地之外，《天朝田亩制度》最关键的两个举措就是对民众实行军政教合一的军事化管理和平均主义的产品分配办法。
根据《天朝田亩制度》规定，每25家形成一个基层单位，称为“两”，设“两司马”主持。每5家设“伍长”一人。每家出1人当兵为伍卒，“有警则首领统之为兵，杀敌捕贼，无事则首领督之为农。”每个基层单位，建立一个“国库”，“凡当收成时，两司马督伍长除足其25家每人所食可接新谷外，余则归国库，凡麦、豆、苎麻、布帛、鸡、犬各物及银钱亦然”。各家遇有婚丧嫁娶和生育等事，按规定费用到“国库”领取；鳏寡孤独残废等丧失劳动能力的人，也由‘国库‘开支抚养。农民除耕种外，还要利用农闲时间饲养猪、鸡、蚕，从事纺织、缝衣、制作陶器、木活、打石等家庭副业和手工业生产。生产所得，自然也归“国库”所有。
而在两司马之上，还有卒、旅、师、军四级军政教合一的管理单位。其中最大的军可以管辖13156家，师则管辖2631家，旅管理526家，卒管理105家。由此，便将太平天国所统治区域内的全部人民都变成了太平天国战争机器的一分子。
说实在的，这个《天朝田亩制度》对促进社会生产力的发展恐怕不会有多少正面作用。但是若能真的实行起来，倒是一个非常有效的战时体制。可以最大限度地将统治区内的战争潜力动员出来，比满清的部族政治和朱济世所实行的依靠商人士绅管理社会的体制都更有战斗力。
不过，要实行这样一套体制却不大容易。现在杨秀清遇到的一个烦，同朱济世刚开始造反的时候差不多，就是缺乏可靠的干部！如果后世过来的朱济世现在看到《天朝田亩制度》的全部内容，恐怕会立即联想到科学社会主义的土地改革了。两者的共同之处实在是太多了，可是后者拥有的干部和人才，却不是此时的太平天国可比。这个太平天国的最高领袖现在一头扎进了洛阳的后宫，基本不理朝政。而设想出《天朝田亩制度》的杨秀清本人也是个不识字的矿徒，能够琢磨出这么一套东西已经是天才了。这实施推行《天朝田亩制度》的方法，恐怕不是杨秀清可以凭空想象出来的——其实任何一种社会制度，在理论阶段可以依靠天才的头脑进行推论设想，一旦付诸实施，则必须依靠无数实干之才去不断实践，然后再总结经验进行改良，方可找出真正可行的道路。
因而杨秀清在豫西试水《天朝田亩制度》所遇到的种种难题和阻力，也就丝毫不足为奇了。(。请搜索，更好更新更快!)