大明天启七年（公元1627年）九月十九日，朱由校“九虞”之礼的最后一项“送葬”在几筵殿举行，丧礼由英国公张惟主持。
朱由校的灵柩静静矗立在中堂，英俊而年轻的黑白画像，就正靠在灵柩的大头。
先由太师、太傅、太保参拜灵柩，然后是三孤、三公参拜，然后是宗人府宗人令、左右宗正、左右都督、左右宗人参拜，然后是六部尚书、左右侍郎参拜，然后是京师的其他官员参拜，最后是两京十三司派入京师的代表参拜。
朱由校没有男丁，朱由检以弟弟的身份、张嫣以内眷的身份还礼，但他们的身份都是太高，没有在几筵殿下跪，只是分别站在灵柩的后面，隔着布帘躬身还礼。
所有人员参拜完毕，礼部官员鸣炮十五响，预示朱由校是大明的第十五任皇帝。
已时整，朱由校的灵柩被抬上灵车，在一片哭闹声、送行声中，灵车缓缓离开几筵殿，驶向宫门，驶向皇陵。
张嫣哭得死去活来，在灵车离开的一刹那，已经晕了过去。
即使张嫣是清醒的，作为女人，她也不能随灵柩一道，亲眼看着朱由校下葬。她只能茫然地呆在几筵殿，灵柩离开几筵殿的时刻，就是她和夫君的永别……
丧礼完毕，全国停止一切祭祀朱由校的活动，国家同时步入正常的轨道。
九月二十二日，朱由检召见兵部在京的三大尚书崔呈秀、李春烨、王永光，四人密谈大半天，中午朱由检在乾清宫赐了宴，直到黄昏，崔呈秀、李春烨、王永光三人才离开乾清宫。
十月一日，朱由检召开第一次正式的朝会。
崔呈秀、李春烨、王永光三位兵部尚书联名抛出一份《大明军队改革方案》。
《大明军队改革方案》已经印刷多份，在朝堂散发给参加朝会的主要官员，《大明军队改革方案》主要内容有：
一、撤销京师三大营，重新编制新军；
二、新军以班为基本单位，每班十人，另外设班长一名，三个班组成一个排，三个排组
成一个连，三个连组成一个营，三个营组成一个团，三个团组成一个旅，三个旅组成一个师，三个师组成一个军。
每个军有三万三千至三万八千人。
营以上设长官一人，副长官一人，参谋一人。
三、四武营改编成新军第一军，军长袁崇焕，下辖第一师，师长李红军；第二师，师长宁显龙；第三师，师长刘玉闩。
四勇营改编成新军第二军，军长杜文焕。
四威营改编成新军第三军，军长俞冲霄。
神机营改编成新军第四军（军长洪承畴）、第五军（军长沈希夷）、第六军（军长陈有杰）。
以上各军队全部配备火器，从即日起，学习火器的使用，为期五个月。
各军配备直属军部的炮兵团。
三千营改编成新军第七、第八军，军长分别是满桂、成必用。
第七军和第八军，各下辖三个骑兵师，基本不配备火器，但配备大明最锋利的战刀、最精锐的马匹，从即日起开始整顿，为期三个月。
四、皇帝直属的亲军十六卫，除锦衣卫之外的十五卫，改编成皇家第一军、皇家第二军。
皇家第一军军长为原四武营特战队队长王慕九，皇家第二军军长为原金吾右卫指挥使李元亭。
五、待京师各军的火器配备、士兵整顿结束，再依次整顿各地方卫所军队。
六、组建大明海军。
立即以登州为母港，组建北海舰队，北海舰队附设陆战第一、第二、第三师。
逐渐以广州为母港，组建南海舰队。
七、各新军的军饷由户部直接划拨兵部，兵部按整编部队的实际情况足额发放。
八、大明军歌为《精忠报国》，军旗为蓝底红日黄月的日月旗。
军队改革在朝廷不啻于一颗重磅炸弹，但朱由检是新君初立，有些大动作，也是在所难免。