当李春烨在朝会上提出对台湾用兵的时候，大臣们深知，这又是朱由检的意思。
李春烨强调：“对台湾用兵，一方面是收复大明的故土，免得西夷的火炮，架在大明福建沿海附近，同时也是检验南海舰队的战斗力，规模不会太大，而且也不用陆军参战。”
听说陆军不用参战，大臣才相信作战的规模不会太大，加上朱由检刚刚斩了施凤来，朝会上并没多少反对的声音，零星的不和谐，很快就被淹没。
台湾在福建省的东南，面积约三万六千平方千米，南北长约七百五十里，东西宽约三百里，是独立于大海中的岛屿。
台湾对大明来说，有着极为重要的战略意义，但整个岛屿并不平坦，海岸山脉、中央山脉、雪山山脉、玉山山脉、阿里山山脉等五座山脉，从东北向西南，平行窝在台湾岛上，因此台湾的地形，以山地为主，中部为高山，一直向东延伸到大海，只在西部海岸有一些平原和盆地。
荷兰人自天启二年（公元1622年）开始，在台湾登录，天启四年（公元1624年），在台湾南部的汕尾建立商馆，天启五年（公元1625年），在台湾南部的大员建立热兰遮城，在汕尾建立赤嵌城，并逐渐占领台江内海平原上的新港社、目加溜湾社等村落，在与麻豆社的战争中，双方各有胜负，目前处于僵局。
天启六年（公元1626年），西班牙人来到台湾北部，并在鸡笼建立了圣萨尔瓦城，崇祯元年（公元1628年），他们在淡水河口北岸建立了圣多明戈城。
据郑芝龙派出的探子回报，除了商人，荷兰在台湾岛上的驻军约有五百，西班牙也有三百职业军人。
郑芝龙早年多次去过台湾，对台湾的各方势力、地形、人口非常熟悉，他并没有带去整个舰队，只带了二十艘广船、二十条福船、十艘新式福船战舰、一百艘苍山船。
另外还有一百多艘运输船，运送陆战第四师，运输船跟在舰船后面，接受舰船的保护。
广船是三桅船，有两层甲板，左右舷共有十二门火炮，全部是开花弹，乘员八十八人，其中水手二十四人，士兵六十四人，除士兵配备燧发枪和战刀，船上还配备了火药箭、水底雷、火龙出海。
福船是双桅船，只有一层甲板，左右共有八门火炮，乘员只有四十六人，其中水手十四人，士兵三十二人。
而新式福船战舰，虽然与老式福船的吨位差不多，但船上剔除了所有的商用船舱，全部用于部署火炮，左右船舷一共安装了十四门火炮，比广船还多两门。
天蒙蒙亮的时候，郑芝龙告别岸上送行的官员，亲率舰队从福建的厦门港出发，依靠指南针导航，舰队超正东航行。
厦门和澎湖之间，大约只有七十五海里，但风帆时代船速普遍很慢，特别是广船这种大型船只，时速只有七节，加上顺风，连八节都不到，福船、苍山船的速度虽然快点，为了保持完整的编队，只能和广船保持着相同的速度。
午时过后，平静的海面上并没有他国的舰队，郑芝龙命令其中的十条苍山船加速，先行到达澎湖的马港，与先期抵达马港的苍山船汇合，为广船和福船选择停靠地点，同时派人登陆，为后续的士兵安排食宿。
海面上只有微风，但海水还是会掀起半尺高的浪头，幸好士兵们都是自小生活在海边，比这更大的风浪都见过，也不会晕船。
虽然海面上没有其它国家的舰船，偶尔还是可以见到商船，多数是悬挂荷兰的三色旗，或者是西班牙的盾徽旗。
战舰上的明军海军，一直不敢松懈，特别是负责瞭望的哨兵，一刻也不敢大意，这些商船，基本上都是武装过的，甚至还藏有火炮，一旦发现自己受到威胁，开枪开炮那是家常便饭。
不过，明军的舰队足够庞大，这些商船根本不敢靠近，只要明军不挑衅，他们也不敢主动招惹明军。
深秋的天气，白天开始变短，不知不觉中，天色渐渐黑下来，海面上的能见度大大降低，郑芝龙暗暗焦急，虽然战舰上都有指南针，但万一跑偏了，这茫茫的大海、这无边的夜色，还真找不到归途。
忽然，瞭望兵打出旗语：前面发现两条小船，疑似南海舰队的苍山船。
郑芝龙大喜：“一定是来接应我们的，但也不能大意，小心警戒。”
不一会儿，前面的瞭望兵再次打出旗语：果然是南海舰队的苍山船。
两条苍山船徐徐靠近南海舰队的旗舰“南海”号，士兵们通过舷梯爬上“南海”号，向郑芝龙口头汇报了马港的情况。